Im Anhang finden Ihr mal ein kleines Tool von JTL (welches ich im Wiki nicht mehr finden kann).
Das könnt Ihr in eurem Ordner entpacken und dann via domain.de/con-check/index.php aufrufen.
2. Testet mal unterschiedliche PHP Versionen
3. In der Vergangenheit gab es mal Problem mit dem APC
Cache. Sollte mit PHP 7 nicht mehr existieren, aber deaktiviert mal testweise alle caching Erweiterungen wie OPcache und APCu
4. Berechtigungen prüfen ob in dem Ordner auch "Ausgeführt" werden darf