Sind vielleicht die "Anpassungen" das Problem? Mini-Beispiel:
Vorlage Beispiel-X in 5.0.3 standardmäßig: "Halli Hallo Freunde,"
Vorlage Beispiel-Y in 5.0.3 standardmäßig: "Machts gut Freunde"
Shopbetreiber-Z findet erstere so nicht für seine Zielgruppe passend und passt die Vorlage an: "Zum Gruße Freunde"
Das Update auf 5.1.0 ändert vielleicht ein paar Variablen an Vorlage Beispiel-X und ändert Vorlage Beispiel-Y zu: "Machts gut, Freunde!"
Automatisches Update würde bedeuten, dass zwar Beispiel-Y nach dem Update automatisch korrekt wäre, aber Beispiel-X wäre zurückgesetzt auf den vom Shopbetreiber-Z nicht gewünschten Zustand (Halli Hallo Freunde).
Damit also nun alles richtig funktioniert, kann Shopbetreiber-Z beide Vorlagen zurücksetzen, er sollte sich jedoch vorher bei Beispiel-X merken (sichern) was er geändert hat, damit er diese Änderung nach dem Zurücksetzen erneut in der aktualisierten Standardvorlage vornehmen kann.
Wir haben derzeit leider keine Möglichkeit festzustellen, ob ein Shopbetreiber eine Vorlage verändert hat oder nicht (Steht aber noch als Verbesserungsvorschlag aus um zumindest dann automatisch updaten zu können). Wenn ihr keinerlei Anpassungen an Vorlagen gemacht habt: Dann braucht ihr auch nichts (Vorsicht: Alle Sprachen außer Deutsch/Englisch werden beim Zurücksetzen geleert!) an den Vorlagen sichern und könnt einfach zurücksetzen.
Wenn es extensive Anpassungen durch Shopbetreiber (oder deren Entwickler) gibt, die entsprechende Entwicklerkentnisse erfordern, können diese sich mit den Email-diffs (Sammlung von "Zeile X hat sich geändert zu Z") behelfen, die wir fürs Update zur Verfügung stellen.