Im Verzeicihnis /templates/deintemplate/themes/custom. Dort gibt es eine theme.css Datei. Da musst du dein Eintrag machen.
Wobei "deintemplate" (siehe oben) durch den Namen deines eigenen Templates ersetzt werden muss. Den kenn ich aber nicht.
Wichtig ist natürlich dann noch, dass du in deinem
Shop-Backend unter DARSTELLUNG -> TEMPLATES den Punkt "Benutzerdefinierte Template-Dateien verwenden?" auf JA umstellst.