Ich bin nicht sicher ob ich dich richtig verstehe.....
Wurden die Kategorien in der
Wawi gelöscht und im
Shop Abgleich die Änderung nicht mit übernommen?
Wenn das so ist musst du in der Shop Admin unter System --> zurücksetzten die Artikel, Kategorien und Merkmale löschen und dann nochmal einen Abgleich mit dem Wawi starten.
So musste ich es bei mir machen. Das war damals die Lösung von JTL dazu