Das Zahlungsmodul kann dir Zahlungen von deinem Bankkonto abholen und anzeigen. Du kannst außerdem manuell im Zahlungsmodul die Zahlungen vom Konto zu einem Auftrag in der
Wawi zuordnen. Diese Zuordnung kann man aber auch automatisch machen lassen, dann wird eine Zahlung z.b. anhand des Verwendungszwecks der Überweisung zugeordnet.
Wenn du in der Wawi unter Zahlung gehst, und auf Abgleich drückst, zeigt er dir dann die Kontobewegungen von dem Commerzbank Konto an?
Was du beschreibst ist der Eintrag der Zahlung im Auftrag, den das Zahlungsmodul dir eben machen/erleichtern kann.
Bei PayPal kann es z.b. sein das der Webshop die Zahlung mit PayPal ausmacht und der Auftrag dann bereits mit Zahlungsdaten in JTL angelegt wird. Das läuft aber vollkommen unabhängig vom Zahlungsmodul.