Wir hatten dieses Problem auch gehabt. Der Fehler war, dass JTL standardmäßig die falsche Variable (ohne Nachkommastelle) in der Vorlage hinterlegt hat.
Hier die Lösung mit Nachkommastelle:
Cond(Auftragspositionen.MwStSatz > 0, Fstr$(Auftragspositionen.MwStSatz, "?&.##%"), "")